Для того, чтобы получить налоговые льготы на острове, необходимо подать в S.D.M. заявление на португальском языке о выдаче компании лицензии на осуществление деятельности в пределах свободной торговой зоны Мадейры. Заявление подаётся от имени либо уже существующей компании, либо с указанием компании, которую планируется открыть в Португалии с целью ведения бизнеса на Мадейре.
В заявлении необходимо описать деятельность компании, поскольку налоговые льготы не предусмотрены для ряда видов деятельности (например, не предоставляются налоговые преимущества компаниям, занимающимся рубкой леса или рыболовным промыслом). Как правило, налоговые льготы предоставляются компаниям, занимающимся онлайн торговлей, предоставлением услуг в области IT и телекоммуникаций, предоставлением консалтинговых услуг, а также управляющим интеллектуальной собственностью.
В случае, если на момент подачи заявления компания ещё не создана, лицензия на ведение бизнеса на острове будет считаться выданной только после представления доказательств учреждения компании.